Tóth Gergely 1969-ben született Keszthelyen. Általános és középiskolai tanulmányait is itt végezte. 

Pekingben kínaiul tanult (1988-1989), Kantonban talajtant (1989-1994), Budapesten környezettudományokat hallgatott (1994-1996), PhD-disszertációját (2000) a Balaton-felvidék talajaiból, MTA doktori értekezését (2014) Magyarország és Európa földminőségéből írta. 

Az ausztriai Laxenburgban az Alkalmazott Rendszerelemzés Nemzetközi Intézetében Eurázsia földhasználata változásának modellezésével (1995-1996), Tokióban az ENSZ Egyetemen Kína és Magyarország mezőgazdaságának összehasonlító vizsgálatával foglalkozott, mellette a Tokiói Egyetem Tájtervezési Laboratóriumának vendégkutatója (1999). 

Tizenkét éven át (2005-2017) az Európai Bizottság Közös Kutatóközpontjának tudományos főmunkatársa az olaszországi Isprában. Ezalatt az Európai Bizottság Agrárkörnyezetvédelmi Indikátorok Állandó Bizottsága Talajindikátor munkacsoportjának vezetője, továbbá az Európai Unió első egységes talajfelvételezésének, majd talajmonitoring programjának tudományos vezetője.

A keszthelyi Georgikonon először tanszéki mérnök (1994-1995), majd adjunktus (2002-2005), legutóbb egyetemi professzor (2017-2020). Kollégáival megalapította a Talajtani és Környezetinfomatikai Tanszéket. Később a kőszegi Felsőbbfokú Tanulmányok Intézetének főigazgató-helyettese (2021-2025). Az MTA, majd a HUN-REN Agrártudományi Központja Talajtani Intézetének tudományos tanácsadója . 

Az Európai Agrártudományi Társaság ’Mezőgazdaság és Környezet Kapcsolata’ divízió elnökeként és a Nemzetközi Talajtani Unió Talajminősítési és Földhasználat-tervezési Bizottság alelnökeként is tevékenykedett. Az „EU-Kínai Földügyi és Talajtani Panel” alapítója, megalakulásától európai koordinátora. Az ENSZ Globális Talajpartnerség Európai Kutatási és Innovációs Pillérének társelnöke.

Számos hazai és nemzetközi tudományos kutatási projekt résztvevője, konzorciumok vezetője a talajtan, talajtermékenység, talajdegradáció, földminőség és földhasználat területeken. A Talajminőség-Földminőség (Soil Quality – Land Quality) nemzetközi konferenciasorozat fő szervezője.